Спустя три года Ходорковский пришел в нефтяной бизнес. В 1993 году его назначили заместителем министра топлива и энергетики РФ. В 1995 году Михаил обменял 10% акций «Менатепа» на 45% «ЮКОСА», а спустя еще несколько сделок завладел 90%. Он не только вывел нефтяную компанию из кризиса, но и сделал ее одним из лидеров на мировом энергетическом рынке.

В 2003 году Ходорковского неожиданно обвинили в в хищении государственных средств и уклонении от уплаты налогов и приговорили к тюремному заключению. Спустя десять лет указом Владимира Путина бизнесмена освободили. Сейчас олигарх живет в Германии. После выхода из тюрьмы он заявил, что не собирается больше вмешиваться в политику и спонсировать российскую оппозицию.